喷绘机的喷头一般都很昂贵而且精密，宽大的喷头上分布了很多个微小喷嘴，这么多的喷嘴在打印时直接面对打印耗材，不工作时则暴露在外。由于喷嘴孔径大小与漂浮在空间中的尘埃相当，若喷绘机工作环境较差，灰尘较多，细小的喷嘴就很容易被尘埃堵塞。
如果室内温度太高，不仅昂贵的喷绘机的机械部件容易锈蚀，就连喷头也很难保证不被锈蚀。喷绘机工作环境的温度变化幅度不宜太大，这是因为喷绘机中不仅包含有大量的金属部件，还包含有大量工程塑料部件。而喷嘴孔径又十分纤细，如果环境温度变化太快，部件的热膨胀会造成机械部件的过多磨损，喷嘴孔径大小的变化也会影响墨水的打印品质。
喷绘机在工作中出现的问题主要集中在墨水和喷嘴。喷绘机的墨水用量很大，在使用较长时间后，墨水对喷嘴和打印图像有所影响。喷嘴长时间工作所出现的磨损与墨渍堆积也影响了打印图像的质量。所以，墨水的正确选用和喷嘴的正确保养，是每位喷绘机用户在使用中不可忽视的问题。
因此用户首先应该做好墨水的选择。墨水的品质可决定打印图像的质量，也可决定喷嘴的使用寿命。喷绘机墨水的制造是及其复杂的，不管是原装墨水，还是兼容墨水。只要能满足连续打印的质量要求即可。因此，对于耗墨较多的喷绘机，我们完全可以选择‘物美价廉‘的非原装优质墨水。其次就是做好设备与喷头的保养工作。喷头最容易因打印时间过长、墨水使用不当、或长时间搁置不用而堵塞喷孔。当然使用质量不佳的墨水，也会引起喷孔堵塞而影响打印质量，严重时甚至导致整个喷头报废。虽然喷头的制造工艺精细，但其结构并不复杂。与打印介质直接接触的平面上不满了许多微小圆孔，喷孔与插入墨盒的喷嘴相连，从喷嘴到喷孔之间以及喷孔四周常常滞留着附着力极强的墨粉或杂质，只要清除了这些墨粉和杂质，喷头便可恢复正常打印功能。
对于长时间停止使用的喷绘机(比如法定假期期间)，最好是将喷绘机整个供墨系统用清洗液清洗后放置，避免喷孔堵塞。大部分看似报废的喷头，仅仅是喷孔被堵塞而不能工作，只需简单冲洗就能恢复其打印功能。对于打印正常，但缺少笔划或色彩，或高分辨率下图像模糊这种轻微堵塞情况，一般采用喷绘机自带的喷孔清洗程序就可以解决。不过，要注意的是，一旦发现缺少笔划或色彩欠佳等轻微喷孔堵塞时，应及早用清洗程序来清洗。
对于打印过程中机器频繁充墨或清洗喷孔，但打印效果仍然较差或者喷头严重堵塞，机器无法充墨，或喷绘机拒绝工作就只能用手工清洗方法了。手工清洗方法虽不复杂，但因需要拆卸喷头，清洗次数也不宜过于频繁。手工清洗方法是使用注射器和可套在针头上一段橡胶管、清洗液、十倍左右的放大镜、硬塑料小刀等工具。在取下喷头，用放大镜仔细找到被堵塞喷孔的喷嘴，而后用注射器将清洗液注入喷孔，必要时可用硬塑料小刀刮去喷孔边的残留物。使用时注意不要将电极部分污染。
